Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rph3alQ768S4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rph3alQ768S4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rph3alQ768S4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Rph3alQ768S4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rph3alQ768S4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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