Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chd4Q6PDQ2 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms