Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp49Q6P9L4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp49Q6P9L4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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