Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
BC061212Q6P8K3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms