Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q6DFW0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q6DFW0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms