Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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PtprdQ64487 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PtprdQ64487 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprdQ64487 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms