Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcn1Q64347 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clcn1Q64347 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms