Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Irf4Q64287 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms