Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Hes3Q61657 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Hes3Q61657 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Hes3Q61657 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Hes3Q61657 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Hes3Q61657 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hes3Q61657 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms