Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms