Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ncor1Q60974 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms