Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atf3Q60765 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms