Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Sft2d1Q5SSN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms