Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm27Q5SFM8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rbm27Q5SFM8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm27Q5SFM8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rbm27Q5SFM8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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