Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf3Q5HZG4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Taf3Q5HZG4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Taf3Q5HZG4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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