Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam208bQ5DTT3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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