Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnpc3Q3UZ01 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnpc3Q3UZ01 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms