Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pfdn4Q3UWL8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 394.3 ms