Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
BB287469Q3UT53 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BB287469Q3UT53 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms