Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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