Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gpr55Q3UJF0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms