Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Garem1Q3UFT3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Garem1Q3UFT3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms