Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Puf60Q3UEB3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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