Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29188-201ENSMUST00000191173 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms