Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
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