Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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