Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Traf3ip1Q149C2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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