Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Itgb8Q0VBD0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms