Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vps8Q0P5W1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms