Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ccdc28a-205ENSMUST00000174592 882 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Chd8Q09XV5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms