Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sox12Q04890 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms