Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl7Q03366 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms