Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb2Q00977 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms