Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rbp4Q00724 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms