Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Itga4Q00651 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms