Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Apoa1Q00623 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms