Protein–RNA interactions for Protein: Q00196

Pou2f2, POU domain, class 2, transcription factor 2, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f2Q00196 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pou2f2Q00196 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pou2f2Q00196 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pou2f2Q00196 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms