Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SmsP97355 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SmsP97355 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
SmsP97355 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms