Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irx3P81067 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irx3P81067 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irx3P81067 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms