Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Otx2P80206 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms