Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pkn1P70268 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms