Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab3cP62823 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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