Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sem1P60897 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sem1P60897 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms