Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rrp1P56183 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rrp1P56183 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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