Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dbx1P52950 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms