Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fgd1P52734 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms