Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmod1P49813 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms