Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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PtpreP49446 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtpreP49446 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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