Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms