Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Edn3P48299 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms